北京核工业医院体检中心自1994年建院以来即开展体检工作，是第一批获得北京市体检资质的体检单位,是北京市健康管理协会会员单位，是医院“两个中心”重点发展科室之一。

　　2015年1月8日新的体检中心正式运营，建筑总面积1795平方米，体检环境整洁、舒适，按照“医检分离”的原则进行规划和建设，男女宾分区，拥有独立检验中心和CT检查室，和其他30个独立检查诊室。体检中心拥有先进的大型检验设备，配备了CT、DR、MRI、钼靶、彩色超声、电子胃肠镜、血管弹性检测仪、人体成分分析仪等先进的体检设备，开展了常规科室检查项目，临床检验所有项目、肿瘤筛查所有项目等我院均可完成，并开展了冠脉CTA、胸部低剂量CT、头颅核磁共振、无痛胃肠镜、钼靶专项体检及食物不耐受检测、个体遗传基因检测等特色检查项目等200余项体检项目，所有体检项目均可一站式完成，日接待能力300人，年检25000人次。

　　体检中心主要客户包括中央机关、企事业单位、民营企业等，如：国家发改委、财政部、国务院港澳办、中国兵器集团公司、中国科学院、国家信息中心、人民银行营业管理部等。另外目前基本实现了核工业系统在京单位体检全覆盖。

　　北京核工业医院健康管理部成立于2010年7月，是一支由业务副院长亲自挂帅，多名具有丰富临床经验的医务人员组成的健康管理团队。是北京市健康管理协会成员之一。

　　自2010年6月成立以来，以国际前沿的健康管理理念和成熟的健康管理模式为基础，引进先进的健康管理信息化平台，面向央企员工和重点骨干人才，提供包括健康评估、健康干预、慢性病管理、VIP医疗保健、就诊绿色通道、健康咨询、大型活动医疗保障等特色的全方位、全周期健康管理服务。近年来不断向学科建设转变，管理模式不断创新，从单一的帮助就诊服务转变成日常保健为主，慢性病防控为重点的、结合线上、线下多种渠道的管理模式，经济效益增长显著，形成了北京核工业医院特有的健康管理品牌。